Да, показатель преломления зависит от температуры. Соленость - не знаю, но, подозреваю, тоже должна влиять (она влияет на прохождение звуковой волны, следовательно, и на плотность среды). Но! В пределах работы лазерного локатора, как я мыслю, данный фактор не будет сильно влиять, так как интервалы изменения свойств воды будут достаточно велики как по глубине, так и по дальности.
У меня есть одна книжка по геохимии Мирового океана, а в ней табличка, где указаны величины изменения температуры воды в Атлантике (на апрель-месяц, усредненно).
Так вот. От 0 до 25 метров - температура держится в пределах 18 градусов. От 25 метров до 360 (!) - 18-17 градусов. А это основный "эшелон" действия АПЛ по глубине. Ниже, до 920 метров Т воды падает до 15 градусов. Затем опять стабилизация до 3000 метров (зона абиссали) в районе 3-4 градусов Цельсия.