Проблема решена
Никакие манипуляции с генератором стабилизировать частоту не помогли, так что заново изготовил схему на плате, и о чудо, дрейф стал совсем незначительным!, 100-200 Гц падения за первые пол часа после включения и все, частота становится стабильной.
Провел калибровку датчика, и вот что получилось:
Гистерезис- 2,30% Разброс Показаний- 1,88%
Всего погрешность- 4,18%
Хреново конечно, но что поделаешь... Можно попробовать гайки затянуть потуже, но боюсь резьбу сорвать.